Gerer les semences avec PoPy

Gestion et suivi de la biodiversité cultivée

Publié par Jérôme DURY, l'équipe biodiversité, Agrobiopérigord on Monday, November 9, 2020

AgroBio Périgord a développé un outil de gestion et de suivi de la biodiversité cultivée appelé PoPy : Pop pour population et Py pour Python, le langage de programmation utilisé. L’élaboration de PoPy a pour objectif d’accompagner le développement des activités de la Maison de la Semence Paysanne de Dordogne.

Attendu depuis plusieurs années, cet outil permet dans un 1er temps de répondre avec plus d’efficacité aux demandes croissantes de semences populations de maïs et de tournesol (en moyenne 80 lots par année avant 2017, 150 lots par année depuis 2017). Initialement conçu pour gérer les variétés populations de maïs et de tournesol (+ de 150 variétés de maïs populations répertoriées dans notre banque de semences), il a aussi intégré le suivi des échanges des graines potagères (~70 espèces répertoriées et + de 500 variétés). Au-delà des fonctionnalités de suivi logistique des lots de semences, PoPy constitue une véritable base de connaissances permettant le suivi dans le temps et l’espace de la biodiversité cultivée (extrait page suivante).

La connaissance de terrain sur l’usage des variétés populations est très précieuse. Elle nous permet de mieux assurer collectivement la sauvegarde «in situ» de la diversité des variétés population. Nous pourrons ainsi mieux identifier les variétés peu cultivées et donc potentiellement en danger. Le recueil des pratiques nous permettra également d’affiner la connaissance de ces variétés populations et ainsi de mieux accompagner les producteur.trice.s dans leurs choix variétaux en fonction de leurs objectifs de production.

Extrait de la base de données PoPy illustrant graphiquement le suivi des filiations des lots de semences : échanges, diffusions, mélanges, croisements et mises en cultures des variétés populations

Figure 1: Extrait de la base de données PoPy illustrant graphiquement le suivi des filiations des lots de semences : échanges, diffusions, mélanges, croisements et mises en cultures des variétés populations

Une deuxième phase de développement a permis d’intégrer le stockage et l’analyse de données associées à chaque lot de semence. Ces informations concernent toutes les mesures réalisées lors des expérimentations menées sur la plateforme régionale ou chez les paysans, les nombreuses photos, les témoignages etc. Dans le cadre du programme «Cultivons la biodiversité en Nouvelle Aquitaine» et de plusieurs autres programmes de recherche (Solibam…), AgroBio Périgord a en effet accumulé depuis plus de 15 ans une quantité très importante de données. Ces données très diverses ont bien évidemment servi à la construction et à la diffusion de notre savoir sur les variétés populations à travers nos rapports annuels, des publications de livres et des documents techniques. Mais le regroupement et la structuration de ces informations dans une même base de données ouvre de nouvelles perspectives d’analyse, de synthèse et donc de savoir. Cette base a permis, entre autres, la réalisation de fiches descriptives détaillées des variétés populations et la réalisation de méta-analyse sur des thèmes encore peu explorés, comme la teneur en protéine. Parallèlement à ces travaux d’expérimentations que nous continuons, nous souhaitons investir plus encore le potentiel offert par les outils numériques. Nous expérimentons d’ailleurs, l’usage d’outils des sciences participatives (parfois appelées « sciences citoyennes » ou « sciences collaboratives ») afin de faciliter la mise en commun du savoir porté par les paysans sur les variétés populations (voir article sur le web questionnaire).